Le comité des parties prenantes donne voix au chapitre à une diversité d’acteurs tous concernés par les enjeux liés à l’océan : entreprises, artisans et salariés du secteur maritime, associations et ONG, citoyens, collectivités. Son objectif est de permettre à l’institut d’anticiper et de mieux répondre aux attentes de la société vis-à-vis des sciences marines. Tous les membres sont nommés intuitu personae, ils ne sont pas désignés par leurs structures.